两者同为国度电网的下属公司，所以两者都是以国电开通，但没有直接联系；
国电南自是由国度电力公司南京电力自动化设备总厂初次发起，拟以公开募集方式设立。 南自总厂本次股份制改造，将其现有的四个主专业分厂：线路保护分厂（一分厂）、调度自动化分厂（二分厂）、主设备保护分厂（九分厂）、变压器印制板分厂（七分厂）和相应职能管理部门的资产和相应的负债，以及拥有的一家全资附属企业（南京博奥电力自动化公司）、一家控股子公司（南京南自变电站自动化有限公司）。
国电南瑞科技股份有限公司成立于2001年2月28日，是由南京南瑞集团公司作为主发起人，以南京南瑞集团公司下属三家分公司的资产经过重组，联合其它七家战略投资者共同发起设立，2003年9月24日在上海证券交易所上市，简称“国电南瑞”。
南自和南端的区别：二者都是指事物的方位。没有区别。
南自，南，方位词，与“北”相对。出自《资治通鉴》“旌麾南指 。”自，起源的意思。或由、从的意思。《广雅》释义“自，从也。”或者在、于的意思。“南自”意思是指一个事物从南边起或开始。
南端，南方；南边。出自汉 •王逸 《九思•守志》：“绕曲阿兮北次，造我车兮南端。”端，事物的一头、或开头。南端，就是指事物的南边。
国电南自是华电下属单位。
国电南瑞是国网公司下属单位。